Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms