Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms