Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms