Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H3F3CQ6NXT2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms