Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms