Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms