Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF220Q5VTB9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms