Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms