Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMER1Q5JTC6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms