Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms