Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms