Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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