Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00303Q3SY05 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms