Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKOR2Q2VWA4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKOR2Q2VWA4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms