Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL40Q2TBA0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms