Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf58Q2M2W7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms