Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms