Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FXNQ16595 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms