Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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