Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NTRK3Q16288 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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