Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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