Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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