Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIP13Q15645 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms