Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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