Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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