Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms