Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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