Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms