Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM2Q13029 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
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