Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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