Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXO1Q12778 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXO1Q12778 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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