Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms