Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHDQ02161 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHDQ02161 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHDQ02161 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHDQ02161 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms