Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms