Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKD1P98161 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PKD1P98161 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PKD1P98161 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PKD1P98161 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PKD1P98161 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PKD1P98161 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKD1P98161 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKD1P98161 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKD1P98161 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKD1P98161 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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