Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARF3P61204 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARF3P61204 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms