Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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