Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms