Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MANFP55145 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MANFP55145 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MANFP55145 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms