Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AQP4P55087 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AQP4P55087 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms