Protein–RNA interactions for Protein: P54756

EPHA5, Ephrin type-A receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA5P54756 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA5P54756 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms