Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms