Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms