Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms