Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms