Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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