Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
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