Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKACBP22694 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKACBP22694 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKACBP22694 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKACBP22694 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms