Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 378.4 ms