Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPB42P16452 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPB42P16452 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPB42P16452 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPB42P16452 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPB42P16452 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPB42P16452 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPB42P16452 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPB42P16452 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPB42P16452 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms